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     AI抗体设计实测:优化旧抗体胜过从零设计

AI抗体设计实测:优化旧抗体胜过从零设计

【卡城华人网 www.calgarychina.ca】  2026-10-10 10:40
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【卡城华人网】AI抗体设计实测:优化旧抗体胜过从零设计

AI 设计抗体实测出炉:最佳化既有抗体成效最佳,从零设计仍需实验把关

人工智慧(AI)正逐步改变新药研发方式,改良治疗用抗体正是最受期待的应用之一。抗体是能辨识特定标的的蛋白质,已用于治疗癌症、自体免疫疾病与感染症。不过,盲测竞赛「AIntibody」显示,AI 改良既有抗体的表现亮眼,但挑选最佳候选与从零设计新抗体时,可靠度仍明显不足。



生物学家William A. Haseltine《富比士》(Forbes)专文表示,这项竞赛共有29个组织参与,提交511个AI设计或筛选的抗体,再由实验室实际制造测试。所有抗体都针对新冠病毒(SARS-CoV-2)的同一种蛋白质。

评估重点有二,一是亲和力(affinity),即抗体与标的结合的强度;二是可开发性(developability),即抗体是否具备成为药物所需的物理性质。结合力再强的抗体,若不稳定、易沾黏其他分子或结块,仍难成药。

竞赛分为三关。第一关要求AI改良既有抗体,成果最明确,约13%的提交作品在维持可开发性的同时,让结合强度提升至少20倍,结果之一亲和力更媲美传统实验方法的最佳成果。 AI可望以少量候选取代耗时数周、动辄数千种组合的实验筛选。

第二关要求AI从一群相近的候选抗体找出最强者,多数方法的表现却与随机挑选无异,仅一个团队持续胜过随机基准。文章指出,提升结合力的序列修改,可能同时造成不稳定或误结合非预期标的,AI必须兼顾多项特性,难度远高于比对过往成功案例。

第三关要求AI设计原始资料库未出现的全新序列,结果好坏参半。约三分之一作品能在低于1奈莫耳(nM)浓度下结合标的,但许多设计完全无法结合,且结合力最强者常有可开发性问题。

Haseltine认为,亮眼的预测不等于有效的药物。 AIntibody要求所有预测在相同条件下接受实验检验,为评估哪些方法真正有效提供基准。 AI终将减少抗体研发所需的大量实验,但现阶段最有效的做法,是用AI让实验规模更小、速度更快,也更具针对性。

来源: TechNews

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